
2002年的SARS疫情、2019年的新冠疫情股市怎么加杠杆交易,两次全球性公共卫生事件都将溯源的目光投向了蝙蝠,让我们深刻意识到了解蝙蝠体内的病毒生态就是守护人类自身安全的重要防线。
然而,长期以来,我们对蝙蝠病毒的认知大多停留在单一病毒的检测与追踪上,却忽略了一个关键问题:当蝙蝠携带SARSr-CoV时,它的体内是否还存在其他微生物?这些微生物之间是否会相互作用,进而影响病毒的致病性和跨物种传播风险?
由中国科学院武汉病毒研究所、广州国家实验室等机构联合开展的一项长达16年的监测研究,终于揭开了这一神秘面纱,相关成果发表于《Virologica Sinica》,题为“Individual virome analysis reveals the general co-infection of mammal-associated viruses with SARS-related coronaviruses in bats”,这篇文章为我们理解蝙蝠病毒的共循环机制、提升疫情防控能力提供了全新的科学视角。

这项横跨2004至2019年的研究,覆盖了我国南方和中部10个省份,聚焦9种蝙蝠,最终筛选出238份SARSr-CoV阳性样本,并从中选取76份高质量样本进行宏基因组测序分析。这也是目前国内针对蝙蝠SARSr-CoV阳性个体开展的最系统、最长期的病毒共感染研究之一。不同于以往多采用混合样本测序的方式,该研究首次聚焦“个体蝙蝠”,精准捕捉每一只携带SARSr-CoV的蝙蝠体内的微生物组成,避免了混合样本掩盖个体差异的局限,让我们得以清晰看到蝙蝠体内病毒“共生”的真实图景。

研究团队通过严格的测序与分析流程,不仅检测到了多种与SARSr-CoV共循环的病毒,还发现了大量可能对人类致病的细菌和真菌,更意外收获了25个全新的病毒基因组,其中部分属于从未被发现的进化谱系,为病毒学研究填补了多项空白。
研究发现SARSr-CoV与其他哺乳动物相关病毒存在很高比例的共感染现象。在76份SARSr-CoV阳性样本中, 19份的样本至少还携带一种其他哺乳动物相关病毒,占比25%。
这些共感染的病毒,不仅种类多样,来源也各有不同,大致可分为三类。第一类是与蝙蝠长期共存的哺乳动物相关病毒,除了阿尔法冠状病毒,还包括蝙蝠疱疹病毒、正布尼亚病毒、小RNA病毒、环病毒等,其中蝙蝠疱疹病毒的检出率高达67.1%,在51份样本中均有发现,且与人类β疱疹病毒7型存在关联。第二类是与蝙蝠饮食相关的病毒,主要来自植物和昆虫,比如属于布尼亚病毒目的病毒,其主要物种为只感染植物的纤细病毒属,还有昆虫相关的痘病毒,这些病毒大概率是蝙蝠通过捕食昆虫、取食植物等方式摄入体内的。第三类则是与蝙蝠微生物组相关的病毒,包括与变形虫相关的巨型病毒科、与细菌相关的有尾噬菌体,以及与真菌相关的 Chrysoviridae 病毒科,这些病毒大多依附于蝙蝠体内的共生微生物而存在。
除了病毒,研究团队还在蝙蝠样本中发现了多种可能对人类致病的细菌和真菌,进一步凸显了蝙蝠体内微生物环境的复杂性。在所有样本中,变形菌门细菌无处不在,这一门类包含了大肠杆菌、沙门氏菌、弧菌等多种致病菌,其中志贺菌和沙门氏菌分别在48份和50份样本中被检测到,分布范围覆盖多个省份和蝙蝠物种。此外,与李斯特菌相关的细菌在24份样本中被发现,其中3份样本的基因覆盖率超过99%,意味着这些细菌与致病性李斯特菌高度相似。更值得警惕的是,能产生肉毒杆菌神经毒素、导致人类和动物肌肉麻痹的肉毒杆菌相关物种,在75份样本中被检出,覆盖率高达98.7%,部分样本的基因覆盖率甚至超过95%。真菌方面,可导致人类肺组织胞浆菌病的荚膜组织胞浆菌,在6个省份的4种蝙蝠样本中被发现,进一步提示蝙蝠作为微生物载体的潜在风险。

研究的另一项重大突破,是发现了25个全新的病毒基因组,这些病毒分属于6个不同的病毒科,涵盖哺乳动物相关病毒、昆虫相关病毒和植物相关病毒。其中,5个圆环病毒科的病毒形成了环病毒属的新谱系,与已知病毒的序列相似度仅为8.1%至27%;6个冠状病毒均属于阿尔法冠状病毒属,其中部分与HKU2相关冠状病毒相似度较高,另有3个与BtRf-AlphaCoV亲缘关系密切;还有1个小RNA病毒、2个细小病毒科病毒,以及10个昆虫相关的双顺反子病毒科病毒和1个植物相关的 Solemoviridae 病毒,这些新病毒的发现,不仅丰富了病毒基因库,也为研究病毒的进化历程提供了重要素材。

这项研究的意义,远不止于发现新病毒和共感染现象。它首次清晰勾勒出SARSr-CoV阳性蝙蝠体内的微生物全景,填补了以往蝙蝠病毒研究中“重单一病毒、轻整体生态”的空白。
研究团队指出多种病毒的共感染可能会增加病毒重组的风险——不同冠状病毒之间的基因重组,有可能产生新的病毒变异株,进而提升病毒跨物种传播的能力;而蝙蝠体内的致病菌,也可能通过接触传播等方式,对人类健康构成潜在威胁。此外,研究还揭示了蝙蝠病毒的两大主要来源:长期在蝙蝠种群中循环的哺乳动物相关病毒,以及反映蝙蝠饮食和生存环境的环境相关病毒,这为后续的病毒监测和防控提供了明确的方向。
作为自然界中重要的病毒载体,蝙蝠的病毒生态一直是疫情防控的重点研究领域。这项长达16年的坚守与探索,不仅让我们更深入地了解了SARSr-CoV的共循环机制,也为未来的病毒监测、风险评估和防控策略制定提供了坚实的科学依据。研究团队表示,后续将进一步深入研究这些共感染微生物之间的相互作用,以及新发现病毒的致病性和传播风险,为守护人类公共卫生安全筑牢防线。
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/

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